nature-experiment-log
Automatically organize raw experimental materials (images, voice, text) into standardized experiment logs with YAML frontmatter and write them to an Obsidian vault; it auto-generates experiment IDs and sample batch IDs, supports anomaly logging and indexing, making scientific data traceable and searchable.
npx skills add https://github.com/yuan1z0825/nature-skills --skill nature-experiment-logBefore / After Comparison
1 组Users manually record experiments, spending a lot of time organizing images, transcribing voice, and writing uniformly formatted logs, often missing key fields and making later retrieval difficult.
This skill automatically extracts information from raw materials, generates standardized logs, and writes them into the vault, ensuring complete fields and consistent naming, significantly reducing organization time.
experiment-log — 实验日志标准化
触发条件
用户通过以下任一方式提交实验原始材料时自动加载:
- 路径 A — CLI 直接提交(图片 / 语音转录 / 文字)
- 路径 B — 发到飞书科研群,通过
feishu-cli-integration扫描
前置依赖
需要配合 feishu-cli-integration skill 使用。确保:
- 飞书 bot 已添加到目标群
- bot 权限:
im:message+im:resource+im:message.group_msg - 群 ID 配置在 skill 上下文中
处理流程
- 接收材料 → vision_analyze 读图 + 提取结构化信息
- 生成实验 ID + 样品批次 ID
- 写出标准日志到
wiki/实验日志/{体系}/{类型}/{exp_id}.md - 原始材料(图片等)归档到
raw/experiments/YYYY.MM.DD_描述_EXPID/ - 日志末尾加「原始材料」段落,引用 raw 路径
- 检查异常 → 有则追加
异常记录.md - 追加操作记录到日志索引
- 告知用户写入位置
模糊信息(温度记不清、样品编号不明)主动询问,不猜测写入。
目录结构
/vault/
├── raw/experiments/ ← 原始层(归档)
│ └── YYYY.MM.DD_描述_EXPID/
│ ├── 笔记.md
│ ├── 图片/
│ └── 语音/
│
wiki/实验日志/ ← 标准层(产出)
├── 实验索引.md
├── 异常记录.md
├── {体系A}/
│ ├── 实验类型1/
│ ├── 实验类型2/
│ └── ...
├── {体系B}/
│ └── ...
└── 公共/
└── 设备与试剂追踪.md
实验 ID 规则
{体系代码}-{设备代码}-YYMMDD-{序号}
│ │ │ └─ 当日序号(001 起)
│ │ └─ 日期
│ └─ 设备代码(M=马弗炉, T=管式炉, E=电化学, G=手套箱, F=可控气氛炉, B=通用)
└─ 体系代码(自定义,如 CL / NO / OX / HY 等)
样品批次 ID 规则
{体系代码}-{候选编号}-B{序号}
│ │ └─ 配盐批次序号
│ └─ 候选配方编号
└─ 体系代码
同一批样品跨多个实验时 sample_batch 保持一致,便于 dataview 追踪。
设备代码
| 代码 | 设备 | 场景 |
|---|---|---|
| M | 马弗炉 | 热处理、浸泡腐蚀 |
| T | 管式炉 | 气氛控制、脱水、热稳定性 |
| E | 电化学工作站 | CV/SWV/EIS |
| G | 手套箱 | 配盐、称量、取样 |
| F | 可控气氛炉 | 精密气氛控制 |
| B | 通用 | 干燥、清洗、制样 |
按实际设备扩展。
Obsidian 集成
本 skill 设计为与 Obsidian vault 配合使用。Obsidian 是一个基于本地 Markdown 文件的笔记系统,配合 Dataview 插件可实现实验数据的动态查询和仪表盘。
为什么用 Obsidian:
- 所有日志为纯文本 Markdown,可版本控制、可全文搜索
- YAML frontmatter 结构使 dataview 可自动生成实验列表、异常汇总、设备使用记录
- 本地存储,无云依赖性,数据安全
安装 skill 后需在 vault 中创建以下文件:
| 文件 | 模板 | 用途 |
|---|---|---|
实验日志/实验索引.md | templates/experiment-index.md | Dataview 查询仪表盘 |
实验日志/异常记录.md | templates/anomaly-log.md | 异常记录 |
实验日志/公共/设备与试剂追踪.md | templates/equipment-tracking.md | 设备与试剂追踪 |
将模板文件复制到你的 Obsidian vault 对应位置即可使用。
参考示例
references/ 目录包含三个完整的实验日志示例,覆盖常见实验类型:
| 文件 | 实验类型 |
|---|---|
references/example-log.md | 材料腐蚀浸泡实验 |
references/example-electrochemical.md | 电化学表征(CV 窗口测试) |
references/example-thermal-stability.md | 热稳定性实验 |
每个示例均包含完整的 YAML frontmatter 和 Markdown 正文,可直接作为模板修改使用。
飞书 CLI 操作要点
路径 B 使用 feishu-cli-integration skill:
- 拉消息:
lark-cli im +chat-messages-list --chat-id oc_*** --page-size 30 --sort asc - 下载图片:
lark-cli im +messages-resources-download --message-id *** --file-key *** --type image --output <相对路径> - ⚠️
--output只接受相对路径,先cd到raw/experiments/归档目录
群 ID 和 bot 权限按 feishu-cli-integration skill 的配置获取。
自定义指南
- 体系代码:按你的实验体系自定义(如 CL/NO/OR/PO)
- 实验类型:在
wiki/实验日志/{体系}/下按需创建子目录 - YAML 字段:模板是建议结构,可增删字段
- 设备代码:按实际实验室设备扩展
相关文件
| 文件 | 用途 |
|---|---|
references/example-log.md | 完整实验日志示例 |
wiki/实验日志/实验索引.md | Dataview 仪表盘 |
wiki/实验日志/异常记录.md | 异常记录格式 |
wiki/实验日志/公共/设备与试剂追踪.md | 设备、试剂追踪 |
nature-experiment-log 技能
nature-experiment-log 用于把实验图片、语音、文字和零散观察整理成可追溯的结构化实验日志,并写入 Obsidian 或普通 Markdown 工作流。
适合用它做什么
- 将当天实验记录整理成带 YAML frontmatter 的标准日志。
- 从照片、显微图、称量记录、仪器截图或语音转写中提取实验要素。
- 为样品、条件、观察、异常、下一步动作和原始附件建立稳定链接。
- 把飞书、聊天记录或 CLI 输入中的原始材料归档为同一套实验记录格式。
典型请求
- “记录一个实验:316L 在 500°C 氯盐腐蚀 300 h,Ar 气氛,失重 0.0032 g。”
- “把这几张实验照片整理成今天的 Obsidian 实验日志。”
- “根据这段语音转写补一条标准实验记录,并列出缺失信息。”
你需要提供
- 实验日期、样品、条件、处理步骤、观察结果或原始附件。
- 目标 vault / 输出目录;如果没有指定,技能会先生成可保存的 Markdown。
- 需要固定的命名规则、项目编号或样品编号。
产出
- 一条带 YAML frontmatter 的实验日志。
- 对原始图片、音频、表格或聊天记录的附件索引。
- 缺失字段清单和后续实验动作建议。
边界
- 不会替作者编造温度、时间、配比、设备型号或实验结果。
- 对无法从材料中确认的信息,会保留
AUTHOR_INPUT_NEEDED或中文确认项。 - 飞书、Obsidian 等外部写入能力取决于本机是否已配置相应 CLI 或目录权限。
相关技能
nature-data:把实验数据整理成投稿用 Data Availability 与 FAIR 清单。nature-figure:把实验数据或图像进一步做成投稿级图件。
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